More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_06291 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  100 
 
 
290 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  97.93 
 
 
290 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  92.07 
 
 
291 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  89.31 
 
 
290 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  76 
 
 
290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  76.73 
 
 
290 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  76.41 
 
 
289 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  70.11 
 
 
291 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  68.53 
 
 
289 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  69.29 
 
 
274 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  55.67 
 
 
294 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  51.67 
 
 
285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  52.4 
 
 
303 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  53.9 
 
 
304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  46.72 
 
 
285 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  46.77 
 
 
297 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  46.77 
 
 
297 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  46.77 
 
 
297 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  48.3 
 
 
280 aa  255  6e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  47.25 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  46.47 
 
 
285 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  46.64 
 
 
294 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  46.97 
 
 
287 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  46.59 
 
 
287 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  45.42 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  49.06 
 
 
276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  44.6 
 
 
285 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  45.71 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  44.44 
 
 
285 aa  241  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  48.31 
 
 
312 aa  241  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  43.7 
 
 
285 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.97 
 
 
286 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.97 
 
 
286 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.97 
 
 
286 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.97 
 
 
286 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.97 
 
 
286 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  44.03 
 
 
285 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  45.72 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  45.72 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  46.04 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  46.18 
 
 
291 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  46.3 
 
 
282 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  44.44 
 
 
285 aa  238  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  45.72 
 
 
294 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  44.07 
 
 
285 aa  238  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  45.32 
 
 
286 aa  238  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  43.96 
 
 
286 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  44.6 
 
 
280 aa  235  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  47.89 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  46.42 
 
 
286 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  48.89 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  43.33 
 
 
286 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  43.17 
 
 
288 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  44 
 
 
288 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  43.59 
 
 
277 aa  228  8e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  48.63 
 
 
285 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  49.03 
 
 
279 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  46.54 
 
 
275 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  49.44 
 
 
289 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  45.45 
 
 
299 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  45 
 
 
282 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  44.62 
 
 
282 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  44.62 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  44.62 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  46.97 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  44.62 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  43.22 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  44.15 
 
 
286 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  44.15 
 
 
286 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  43.77 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  47.74 
 
 
314 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  46.21 
 
 
278 aa  218  1e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  44 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  44 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  45.53 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  42.8 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  42.45 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  45.49 
 
 
295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  41 
 
 
279 aa  211  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  43.19 
 
 
285 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  45.8 
 
 
289 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  42.41 
 
 
292 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  39.7 
 
 
281 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  42.8 
 
 
285 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  41.29 
 
 
278 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40 
 
 
279 aa  208  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  41.29 
 
 
278 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  39.93 
 
 
300 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  50.57 
 
 
291 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  47.7 
 
 
294 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.87 
 
 
285 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  41 
 
 
280 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  44.49 
 
 
276 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  43.06 
 
 
287 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  38.91 
 
 
290 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  38.91 
 
 
290 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  40.82 
 
 
278 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  40.82 
 
 
278 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  41.49 
 
 
301 aa  199  6e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  39.05 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>