More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4182 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  100 
 
 
285 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  44.84 
 
 
276 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  45.45 
 
 
264 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  39.41 
 
 
272 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  46.4 
 
 
268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  39.84 
 
 
272 aa  192  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  41.88 
 
 
277 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  39.11 
 
 
277 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  40.38 
 
 
277 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
270 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  44.05 
 
 
280 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  41.6 
 
 
284 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  35.96 
 
 
274 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
277 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  38.87 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  38.87 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  38.87 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  38.87 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  38.87 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  35.32 
 
 
274 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  38.49 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
277 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  36.33 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  42 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  40.62 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  40.38 
 
 
277 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  40.23 
 
 
269 aa  176  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  37.1 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  35.87 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  38.71 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  35.87 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  39.3 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  38.82 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  42.69 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  40.71 
 
 
269 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.8 
 
 
270 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
272 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  38.01 
 
 
277 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.56 
 
 
277 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  36.23 
 
 
266 aa  168  9e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  37.41 
 
 
300 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  36.27 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  39.38 
 
 
330 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  36.65 
 
 
282 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  36.36 
 
 
279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  36.36 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  39.51 
 
 
297 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  36.54 
 
 
268 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  41.9 
 
 
339 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  35.74 
 
 
361 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.08 
 
 
310 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  36.7 
 
 
266 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.52 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  40 
 
 
301 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  38.76 
 
 
273 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  40.15 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  35.93 
 
 
271 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  38.22 
 
 
287 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  39.1 
 
 
312 aa  149  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  32.94 
 
 
264 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  36.58 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.05 
 
 
285 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  30.95 
 
 
272 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.66 
 
 
272 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  35.54 
 
 
326 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  35.52 
 
 
336 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  34.2 
 
 
277 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  33.08 
 
 
280 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  36.15 
 
 
337 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  34.65 
 
 
262 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.08 
 
 
281 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  34.29 
 
 
300 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  35.06 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  35.16 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.98 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  32.35 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  32.96 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 
277 aa  140  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  36.26 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  34.26 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  37.04 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  33.86 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  33.86 
 
 
261 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  33.86 
 
 
261 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  31.72 
 
 
272 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>