More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1710 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  100 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  50.58 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  43.25 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  43.13 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  41.6 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  41.98 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  39.64 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  38.91 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  40.94 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  37 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  41.73 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  39.64 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  39.64 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  40 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  41.06 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  41.92 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  34.98 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  36.33 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  35.36 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  36.54 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  34.13 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  36.92 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.08 
 
 		 269 aa  161  8.000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 291 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 291 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  35.47 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  30.3 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  35.29 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.22 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.1 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 272 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.66 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.48 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  30.51 
 
 		 285 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  30.57 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  30.97 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  31.02 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 337 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  29.14 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  29.15 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.26 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.01 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  27.78 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  29.26 
 
 		 276 aa  128  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  25.64 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  27.82 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.43 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  28.24 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 339 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.99 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.91 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  31.72 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.73 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.08 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  30.38 
 
 		 357 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.47 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  27.59 
 
 		 312 aa  122  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.68 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.56 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.56 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.56 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  31.33 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  28.92 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  28.92 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  32.53 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.16 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  30.77 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  30.89 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  35.45 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  27.27 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  28.19 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  28.17 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>