More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2417 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  100 
 
 		 269 aa  517  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  65.13 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  61.8 
 
 		 270 aa  301  9e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  41.89 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  36.47 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  36 
 
 		 284 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  36.13 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.96 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  35.36 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  33.96 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  34.22 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.66 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.66 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.66 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.66 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.66 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  35.16 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  32.83 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  36.19 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  32.83 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  36.03 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  34.63 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  33.96 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  33.95 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  33.95 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  32.56 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  32.82 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.45 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  35.63 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  32.43 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.56 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 361 aa  132  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.7 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.85 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.85 
 
 		 310 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.6 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.72 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  27.38 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  30.45 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.6 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  27.48 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  32.07 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  33.64 
 
 		 320 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  32.17 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  27.44 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  29.81 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  25.56 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  30.19 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  25.56 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  29.81 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  29.81 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  29.81 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.76 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  34.56 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.42 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.79 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  33.05 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  29.96 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  26.14 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  31.5 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  32.64 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  30.57 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.62 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  32.64 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.62 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>