More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6302 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  100 
 
 		 262 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  99.24 
 
 		 262 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  86.64 
 
 		 262 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  87.4 
 
 		 262 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  86.64 
 
 		 262 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  88.51 
 
 		 262 aa  387  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  85.38 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  85.77 
 
 		 260 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  85.38 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  85.38 
 
 		 260 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  84.23 
 
 		 262 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  66.67 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  64.17 
 
 		 273 aa  298  5e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  65.12 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  62.31 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  64.53 
 
 		 261 aa  284  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  64.29 
 
 		 272 aa  284  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  66.54 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  62.07 
 
 		 270 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  59.69 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  59.84 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  62.07 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  58.91 
 
 		 271 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  60.24 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  60.24 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  60.24 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  60.24 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  60.63 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  59.84 
 
 		 261 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  59.84 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  60.24 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  60.24 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  60.24 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  59.84 
 
 		 261 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  60.24 
 
 		 261 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  54.33 
 
 		 261 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  59.84 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  59.84 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  59.45 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  57.54 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  57.14 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  56.37 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  57.31 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  57.47 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  57.47 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  57.47 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  61.47 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  60.15 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  57.09 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  58.73 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  60.17 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  56.69 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  57.54 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  58.69 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  49.61 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  53.94 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  53.17 
 
 		 265 aa  218  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  54.55 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  54.55 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  47.51 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  51 
 
 		 270 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  53.31 
 
 		 260 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  53.17 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  52.48 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  38.62 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  35.16 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  38.02 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  34.36 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  37.55 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  34.11 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.59 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  35.38 
 
 		 280 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  34.75 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  37.64 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  38.08 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.42 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  34.25 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.56 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.43 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.9 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.12 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  33.06 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  35.36 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.56 
 
 		 280 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35 
 
 		 277 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  32.56 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  33.19 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  35.83 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.66 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  35.6 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  27.69 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.94 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>