More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1727 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  100 
 
 		 267 aa  504  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  71.86 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  67.08 
 
 		 266 aa  294  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  65.45 
 
 		 273 aa  293  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  61.44 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  61.2 
 
 		 272 aa  288  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  60.24 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  56.57 
 
 		 271 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  55.78 
 
 		 271 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  64.44 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  60.74 
 
 		 262 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  57.37 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  56.57 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  61.64 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  60.61 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  61.64 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  56.22 
 
 		 261 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  58.01 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  56.57 
 
 		 275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  56 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  56.75 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  57.37 
 
 		 286 aa  248  5e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  60.78 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  54.22 
 
 		 261 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  60.78 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  60.34 
 
 		 260 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  56.97 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  55.02 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  49.4 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  53.82 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  53.41 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  53.01 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  53.01 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  53.01 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  53.01 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  53.41 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  53.41 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  53.01 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  53.01 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  53.41 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  52.59 
 
 		 261 aa  238  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  53.01 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  60.78 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  60.34 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  52.19 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  52.19 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  52.73 
 
 		 261 aa  231  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  52.19 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  51.59 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  53.01 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  50.39 
 
 		 270 aa  225  7e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  51.43 
 
 		 260 aa  224  9e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  50.99 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  53.12 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  56.22 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  53.12 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  53.12 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  46.67 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  49.18 
 
 		 260 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  49.18 
 
 		 260 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  48.88 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  48.77 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  47.49 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  49.59 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  38 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  33.6 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  36.86 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.94 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.85 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  35.66 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  37.05 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  39.27 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  37.12 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  33.9 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  32.54 
 
 		 289 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.94 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.43 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.03 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.13 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  33.87 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  33.18 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 		 275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  35.74 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.51 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0182  ABC-3 protein  41.22 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0759014  decreased coverage  0.00115812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  36.24 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.53 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  35.2 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>