More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3777 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  100 
 
 
270 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  59.39 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  62.4 
 
 
262 aa  278  9e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  62.4 
 
 
262 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  61.83 
 
 
263 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  57.87 
 
 
273 aa  271  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  64.89 
 
 
262 aa  270  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  61.41 
 
 
262 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  62.5 
 
 
262 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  60.16 
 
 
272 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  60 
 
 
273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  60.52 
 
 
261 aa  266  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  53.99 
 
 
271 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  55.21 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  53.82 
 
 
271 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  53.79 
 
 
286 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  62.45 
 
 
266 aa  257  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  64.14 
 
 
260 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  54.72 
 
 
273 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  64.14 
 
 
260 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  63.71 
 
 
260 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  64.38 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  64.14 
 
 
260 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  56.69 
 
 
275 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  57.94 
 
 
261 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  55.56 
 
 
261 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  57.87 
 
 
273 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  53.57 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  53.57 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  54.37 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  54.37 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  53.57 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  53.57 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  53.57 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  53.57 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  54.37 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  54.37 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  54.37 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  56.92 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  53.57 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  53.57 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  53.17 
 
 
261 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  55.51 
 
 
286 aa  238  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  51.79 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  53.28 
 
 
261 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  55 
 
 
260 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  52.17 
 
 
261 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  47.01 
 
 
261 aa  229  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  56.41 
 
 
267 aa  228  8e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  53.91 
 
 
261 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  52.19 
 
 
270 aa  224  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  51.81 
 
 
265 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  53.69 
 
 
261 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  54.29 
 
 
260 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  54.29 
 
 
260 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  55.33 
 
 
261 aa  221  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  54.29 
 
 
260 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  51.33 
 
 
266 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  54.51 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  54.51 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  54.51 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  51.15 
 
 
262 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  47.6 
 
 
268 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  51.02 
 
 
275 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.97 
 
 
266 aa  167  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  32.3 
 
 
267 aa  154  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.23 
 
 
285 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  37.65 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.85 
 
 
272 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.98 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  36.16 
 
 
277 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  34.47 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.08 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  32.6 
 
 
274 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.54 
 
 
304 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.2 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.25 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  38.8 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.5 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.02 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.02 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.25 
 
 
287 aa  126  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.37 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  38.82 
 
 
277 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.25 
 
 
288 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
277 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.27 
 
 
281 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.28 
 
 
278 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.28 
 
 
278 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.95 
 
 
287 aa  122  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.08 
 
 
280 aa  122  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.51 
 
 
272 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  33.88 
 
 
289 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.57 
 
 
272 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  38.24 
 
 
277 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.74 
 
 
277 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.24 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>