More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3154 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  95.37 
 
 		 260 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  95.37 
 
 		 260 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  70.52 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  65.38 
 
 		 260 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  70.92 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  62.55 
 
 		 270 aa  285  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  64.9 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  52.49 
 
 		 271 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  52.49 
 
 		 271 aa  248  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  51.75 
 
 		 286 aa  234  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  50.97 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  51.72 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  49.61 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  53.94 
 
 		 270 aa  225  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  48.84 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  49.6 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  49.6 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  49.6 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  49.6 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  49.6 
 
 		 261 aa  223  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  49.6 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  49.6 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  49.6 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  49.6 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  52.14 
 
 		 275 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  49.03 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  49.03 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  49.03 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  49.03 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  49.03 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  50.6 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  51.75 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  50 
 
 		 272 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  51.36 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  51.75 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  52.94 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  49.22 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  46.67 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  53.28 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  53.28 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  46.9 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  50.21 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  54.51 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  47.22 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  48.03 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  41.09 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  49.39 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  47.86 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  48.45 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  51.05 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  51.36 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  53.49 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  48.41 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  48.41 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  53.1 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  48.41 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  51.84 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  52.33 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  53.49 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  51.36 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  42.02 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.16 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  47.06 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  44.23 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 		 267 aa  162  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  31.78 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  35 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  35.51 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  36.98 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  35.1 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  32.64 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  36.9 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  36.51 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.54 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.06 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.79 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.28 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.59 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  35.14 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.39 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  26.85 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.39 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.07 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  35.02 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  30.56 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.67 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  37.89 
 
 		 303 aa  101  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  32.42 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11121  hypothetical protein  36.55 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.314432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>