More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2382 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  100 
 
 		 271 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  97.42 
 
 		 271 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  79.26 
 
 		 270 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  73.38 
 
 		 273 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  73 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  78.54 
 
 		 275 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  73.38 
 
 		 286 aa  346  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  76.05 
 
 		 273 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  59.22 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  61.72 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  58.08 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  58.14 
 
 		 262 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  56.15 
 
 		 263 aa  258  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  58.17 
 
 		 266 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  61.22 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  53.26 
 
 		 260 aa  252  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  51.55 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  59.34 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  59.34 
 
 		 262 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  59.58 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  60 
 
 		 262 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  53.99 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  53.04 
 
 		 261 aa  245  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  52.23 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  52.23 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  50.57 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  52.59 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  52.23 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  52.23 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  52.23 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  52.23 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  54.88 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  53.04 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  51.82 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  51.82 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  60.58 
 
 		 260 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  52.63 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  52.63 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  52.63 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  52.63 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  53.88 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  52.63 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  53.88 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  51.42 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  60.17 
 
 		 260 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  59.75 
 
 		 260 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  51.59 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  51.48 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  51.97 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  54.72 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  51.42 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  56.28 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  60.17 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  45.42 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  51.98 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  59.34 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  52.65 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  53.25 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  53.25 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  53.25 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  49.21 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  53.06 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  49.38 
 
 		 260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  49.6 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.76 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  35.98 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  30.52 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.46 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  34.07 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.21 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.25 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2035  ABC zinc transporter, inner membrane subunit ZnuB  36.55 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.061679 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.8 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2338  hypothetical protein  36.14 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.84 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.84 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.15 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 289 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.85 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.53 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  36.67 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  28.2 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  28.2 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.71 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  28.98 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  29.96 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0182  ABC-3 protein  37.19 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0759014  decreased coverage  0.00115812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.06 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  31.17 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.65 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>