More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3000 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  100 
 
 		 285 aa  554  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  48.05 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  42.09 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  40.6 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  40.43 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  39.78 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  38.55 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.55 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  41.73 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  43.07 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  38.38 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  37.92 
 
 		 280 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  38.7 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  38.7 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 		 277 aa  178  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  37.69 
 
 		 300 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  36.8 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  37.02 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  37.96 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  37.36 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  42.8 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  37.31 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  40.6 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.51 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  39.47 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  37.78 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  37.78 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  36 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  35.64 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  38.91 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  39.33 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  37.76 
 
 		 306 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  40.3 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  40.47 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  36.98 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  41.51 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  35.23 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  35.23 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  38.99 
 
 		 280 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 290 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  35.82 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  34.42 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  34.4 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  34.13 
 
 		 268 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  40.93 
 
 		 273 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  35.19 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  36.26 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  34.46 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  38.78 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  35.42 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  35.42 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  34.65 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  35.41 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  39.69 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.54 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  33.21 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  34.46 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  39.22 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  34.27 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  34.88 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  35.11 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  32.55 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.06 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  36 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  37.1 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  32.66 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  32.26 
 
 		 290 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  32.45 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.45 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  35.11 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  38.2 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  33.21 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.12 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  33.94 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  35.34 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  33.47 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  34.1 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  30.83 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  37.07 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  34.52 
 
 		 285 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 276 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  33.93 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>