More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01359 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  94.25 
 
 		 261 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  79.69 
 
 		 261 aa  362  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  74.9 
 
 		 260 aa  338  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  64.23 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  61.72 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  62.45 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  58.27 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  59 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  59 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  59 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  59 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  58.62 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  58.62 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  58.62 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  59.77 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  59 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  59 
 
 		 261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  59.39 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  59.39 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  59.39 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  59.39 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  57.48 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  63.07 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  63.07 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  59 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  55.43 
 
 		 273 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  63.07 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  59.62 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  62.5 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  55.56 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  61.69 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  58.62 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  63.11 
 
 		 262 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  53.1 
 
 		 273 aa  264  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  58.24 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  51.55 
 
 		 271 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  58.62 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  58.62 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  58.62 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  51.55 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  52.33 
 
 		 286 aa  260  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  61 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  55.21 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  60.58 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  60.17 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  55.6 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  52.69 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  60.08 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  52.76 
 
 		 286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  61 
 
 		 260 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  61.16 
 
 		 262 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  56.28 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  51.19 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  46.9 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  51.65 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  51.65 
 
 		 260 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  48.83 
 
 		 270 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  50.59 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  47.62 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  49.55 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  47.41 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  47.62 
 
 		 266 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  45.98 
 
 		 275 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.69 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  34.4 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 285 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  31.91 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.54 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  29.46 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  31.15 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  30.61 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.23 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  30.61 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  32.43 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.73 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  31.97 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.92 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.07 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.13 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  32.82 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  30.34 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.02 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  29.76 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.32 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.18 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  28.96 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.5 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>