More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0294 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  100 
 
 		 263 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  64.62 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  62.99 
 
 		 273 aa  315  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  65.38 
 
 		 262 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  63.08 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2749  ABC-3 protein  66.54 
 
 		 266 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  66.8 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  66.39 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  60.15 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  64.53 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  65.83 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  65.83 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  63.39 
 
 		 261 aa  288  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  68 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  66.8 
 
 		 260 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  66.8 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  66.39 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  55.56 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  55.17 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  62.45 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  67.77 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  65.56 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  59.07 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  58.27 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1669  zinc ABC transporter, permease protein  63.05 
 
 		 260 aa  268  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  53.67 
 
 		 273 aa  268  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1727  ABC-3 protein  61.04 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  52.87 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  57.48 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  57.48 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  57.48 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  57.09 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  57.09 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  57.09 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  57.09 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  57.09 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  57.09 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  56.69 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  56.69 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  56.69 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  56.69 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  56.69 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4004  hypothetical protein  56.92 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  51.72 
 
 		 261 aa  254  9e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  56.86 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  54.65 
 
 		 261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2187  ABC transporter membrane spanning protein (zinc)  53.82 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381514  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1029  zinc ABC transporter, permease protein  52.87 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  55.08 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  55.08 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  55.08 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  55.12 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  56.69 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2253  high-affinity zinc transporter membrane component  57.87 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246644  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  49.4 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  50.97 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  49.61 
 
 		 268 aa  222  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3613  hypothetical protein  51.41 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00635836 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3567  ABC zinc tranporter, inner membrane subunit ZnuB  51.24 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3250  ABC-3 protein  51.24 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.161789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0057  zinc transport system permease protein  53.75 
 
 		 262 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  51.81 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3154  hypothetical protein  50.83 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.87263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0190  hypothetical protein  50.83 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.78 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 		 267 aa  152  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  33.74 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.17 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.27 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  36.64 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  36.02 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.38 
 
 		 279 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  35.48 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  34.33 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.02 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.02 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  29.89 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.17 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  33.19 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  31.15 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.35 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.35 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  33.86 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  34 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30.6 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  32.31 
 
 		 312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.03 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.03 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>