More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2192 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  100 
 
 
271 aa  521  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  43.03 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  41.73 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  41.73 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  39.92 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  36.48 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  36 
 
 
264 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.7 
 
 
269 aa  172  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  35.42 
 
 
269 aa  167  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  36.26 
 
 
277 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  36.9 
 
 
277 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  37.2 
 
 
270 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  33.7 
 
 
269 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  35.86 
 
 
276 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  32.6 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  31.41 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  35.14 
 
 
277 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  148  7e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.84 
 
 
269 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  31.75 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  35.93 
 
 
285 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  33.98 
 
 
277 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
277 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  33.98 
 
 
277 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  33.98 
 
 
277 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  33.98 
 
 
277 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  33.98 
 
 
277 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
277 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.98 
 
 
277 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.11 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  31.14 
 
 
326 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  28.68 
 
 
289 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  32.92 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.4 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.55 
 
 
330 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  32.22 
 
 
291 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  35.58 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  30.4 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  31 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  32 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  33.07 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  30.63 
 
 
297 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.46 
 
 
274 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  35.43 
 
 
301 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  31.47 
 
 
290 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  31.47 
 
 
290 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  31.75 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  31.75 
 
 
261 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  31.75 
 
 
261 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.16 
 
 
285 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.46 
 
 
274 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  28.2 
 
 
278 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.51 
 
 
278 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
264 aa  123  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.51 
 
 
278 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  31.35 
 
 
261 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  32.51 
 
 
262 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  31.35 
 
 
261 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  31.58 
 
 
339 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  31.35 
 
 
261 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  31.35 
 
 
261 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.54 
 
 
277 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  31.35 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  31.35 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  30.88 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.21 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  31.72 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  31.35 
 
 
261 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  31.6 
 
 
261 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  31.6 
 
 
261 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  31.6 
 
 
261 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  31.2 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  32.05 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  31.14 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.17 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  30.77 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 
288 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  30.68 
 
 
261 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  32.33 
 
 
285 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.8 
 
 
268 aa  116  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.53 
 
 
288 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.53 
 
 
288 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  29.2 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  28.68 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  32.82 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  29.17 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 
282 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.23 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  29.2 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  30.77 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  27.67 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  30.04 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.71 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  31.46 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  30.53 
 
 
261 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>