More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2049 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  100 
 
 
283 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  57.3 
 
 
291 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  57.84 
 
 
291 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  55.21 
 
 
277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  50.36 
 
 
289 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  52.54 
 
 
300 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  52.31 
 
 
337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  58.46 
 
 
301 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  52.86 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  54 
 
 
339 aa  228  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  47.48 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  50 
 
 
310 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  45.13 
 
 
330 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  43.1 
 
 
308 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  47.29 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  47.69 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  42.08 
 
 
280 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  49.16 
 
 
321 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  39.77 
 
 
272 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  35 
 
 
276 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  36.27 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  35.14 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.24 
 
 
272 aa  145  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  35.43 
 
 
284 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
270 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.96 
 
 
274 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  34.36 
 
 
265 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.1 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  30.68 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  32.95 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  31.58 
 
 
277 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  35.23 
 
 
268 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  34.86 
 
 
277 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  30.37 
 
 
269 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  38.22 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  36.78 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
269 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  30.29 
 
 
269 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.93 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  35.98 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  39.18 
 
 
352 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  40.54 
 
 
320 aa  128  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.51 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  32.46 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  33.57 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  31 
 
 
271 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.07 
 
 
276 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.05 
 
 
281 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  29.72 
 
 
266 aa  124  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35 
 
 
277 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  36.68 
 
 
277 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  31.02 
 
 
277 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.05 
 
 
280 aa  123  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  34.67 
 
 
336 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
277 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
277 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  36.36 
 
 
262 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.29 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  36.71 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  30.82 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  30.29 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  30.29 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  30.29 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  30.29 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.63 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.88 
 
 
275 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  34.98 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.05 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  30.29 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  27.06 
 
 
264 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.52 
 
 
269 aa  118  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  33.46 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  36.17 
 
 
262 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  35.47 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  36.17 
 
 
262 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.55 
 
 
269 aa  115  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.5 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  27.59 
 
 
272 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  35.32 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  35.74 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  33.83 
 
 
405 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  36.28 
 
 
262 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  29.39 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  33.46 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.06 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  30.88 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  31.98 
 
 
261 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 
282 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  32.11 
 
 
261 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  32.11 
 
 
261 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  32.11 
 
 
261 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  32.96 
 
 
289 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  30 
 
 
278 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  30 
 
 
278 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  34.36 
 
 
267 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  32.11 
 
 
261 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  29.2 
 
 
290 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>