More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0463 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  100 
 
 
264 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  53.69 
 
 
277 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  52.11 
 
 
268 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  42.69 
 
 
284 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  41.54 
 
 
270 aa  201  8e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  43.13 
 
 
269 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  43.13 
 
 
269 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.08 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  39.77 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  44.44 
 
 
264 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.76 
 
 
269 aa  188  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  35 
 
 
266 aa  179  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  36 
 
 
271 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  37.84 
 
 
276 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  35.42 
 
 
277 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  32.83 
 
 
269 aa  150  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
277 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
277 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 
270 aa  148  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  35.79 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.79 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.79 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.79 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.79 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.79 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  30.51 
 
 
277 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  33.96 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  32.71 
 
 
277 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  30.34 
 
 
289 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  33.96 
 
 
265 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  33.46 
 
 
326 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.33 
 
 
270 aa  142  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  37 
 
 
277 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.95 
 
 
272 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  34.94 
 
 
280 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32.94 
 
 
285 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  29.53 
 
 
291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  30.16 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  28.63 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  30.08 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  30.35 
 
 
337 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  33.47 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  33.47 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  33.21 
 
 
272 aa  126  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  27.24 
 
 
291 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.06 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  32.57 
 
 
336 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  30.59 
 
 
361 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.43 
 
 
285 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.25 
 
 
274 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  27.06 
 
 
283 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  28.24 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  29.32 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.8 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  28.92 
 
 
339 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  32.03 
 
 
357 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  36.54 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  30.43 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
272 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.34 
 
 
281 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  26.89 
 
 
279 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.25 
 
 
285 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  29.7 
 
 
267 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  29.37 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  28.29 
 
 
337 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  28.09 
 
 
277 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.35 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  29.32 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  28.85 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.97 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  29.5 
 
 
261 aa  109  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  29.77 
 
 
272 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  29.77 
 
 
272 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  28.46 
 
 
310 aa  108  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.23 
 
 
279 aa  108  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  25.76 
 
 
266 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
264 aa  108  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 
278 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.74 
 
 
265 aa  106  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  28.91 
 
 
312 aa  106  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1683  ABC-3 protein  31.82 
 
 
265 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.27 
 
 
278 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.06 
 
 
268 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.88 
 
 
277 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  27.2 
 
 
371 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
267 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.34 
 
 
278 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  27.82 
 
 
275 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.34 
 
 
278 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  26.84 
 
 
308 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  28.68 
 
 
272 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 
267 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 
267 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.78 
 
 
297 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.78 
 
 
297 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.78 
 
 
297 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  29.7 
 
 
277 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>