More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0136 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 
267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  98.13 
 
 
267 aa  509  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  97 
 
 
267 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  68.66 
 
 
269 aa  346  3e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  59.92 
 
 
268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  57.94 
 
 
268 aa  293  2e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  53.91 
 
 
275 aa  277  1e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  52.85 
 
 
264 aa  275  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  48.31 
 
 
269 aa  258  8e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  48.25 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  46.07 
 
 
277 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  50.41 
 
 
273 aa  238  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  48.61 
 
 
279 aa  236  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  49.43 
 
 
275 aa  234  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  47.13 
 
 
273 aa  232  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  44.83 
 
 
272 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  45.21 
 
 
272 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  43.89 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  42.37 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  45.9 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  41.83 
 
 
275 aa  202  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  46.48 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  45.45 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  42.64 
 
 
273 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  44.06 
 
 
269 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  43.33 
 
 
272 aa  186  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
274 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  41.77 
 
 
273 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  41.57 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 
273 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  41.42 
 
 
269 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  41.47 
 
 
269 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  38.96 
 
 
277 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  39.02 
 
 
281 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.63 
 
 
285 aa  158  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  42.91 
 
 
273 aa  148  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.83 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  32.68 
 
 
267 aa  145  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  39.36 
 
 
268 aa  143  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  37.08 
 
 
287 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
293 aa  142  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.87 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.08 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.08 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.01 
 
 
278 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.75 
 
 
274 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.6 
 
 
274 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  32.96 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.44 
 
 
268 aa  135  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.73 
 
 
277 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.72 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  28.46 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  33.88 
 
 
264 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.23 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  31.34 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  34.16 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.47 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  32.7 
 
 
265 aa  128  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.05 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.05 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  32.08 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  33.21 
 
 
277 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.83 
 
 
279 aa  125  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.89 
 
 
289 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  30.74 
 
 
287 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  31.05 
 
 
276 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  33.72 
 
 
264 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
277 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
277 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32.12 
 
 
285 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.07 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  29.3 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  32.34 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  30.5 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  27.78 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  30.04 
 
 
261 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  30.92 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  27.82 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  27.82 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  32.53 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  27.82 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.08 
 
 
277 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.16 
 
 
280 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
277 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  29.2 
 
 
279 aa  118  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  32.8 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.53 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  32.8 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.5 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  27.53 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  29.5 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.29 
 
 
277 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.59 
 
 
285 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>