More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1935 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  100 
 
 		 337 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  49.71 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  53.18 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  55.09 
 
 		 277 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  54.23 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  52.16 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  59.13 
 
 		 289 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  52.31 
 
 		 283 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  49.15 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  48.74 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  44.78 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  56.57 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  46.94 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  49.52 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  49.68 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  50.6 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  52.26 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  40.6 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  35.83 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  35.34 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  38.4 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 264 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  32.4 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  33.97 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  39.42 
 
 		 336 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  39.68 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  37.05 
 
 		 361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  34 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  32.37 
 
 		 277 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  44.14 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  32.84 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  36.15 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  37.11 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.94 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.06 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.06 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.06 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.06 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  31.95 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  31.95 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  31.33 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  31.33 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.06 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  29.41 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  30.35 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  37.12 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.21 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  35.83 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.91 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  36.86 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.68 
 
 		 274 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  33.22 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  33.07 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.18 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  34.14 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  33.71 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  31.8 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  27.14 
 
 		 272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  32.07 
 
 		 269 aa  119  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.07 
 
 		 269 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 289 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.14 
 
 		 277 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.35 
 
 		 280 aa  116  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.64 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  32.97 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  34.44 
 
 		 276 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  30.49 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  29.17 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.64 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.04 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  33.71 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  31.43 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  32.95 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  29.1 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.27 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.73 
 
 		 287 aa  105  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  31.27 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>