More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0987 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  100 
 
 
272 aa  518  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  39.46 
 
 
279 aa  178  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  36 
 
 
285 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  34.35 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.33 
 
 
266 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  31.06 
 
 
275 aa  158  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  31.27 
 
 
281 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0435  ABC-3 protein  41.31 
 
 
262 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.149069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.87 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  33.83 
 
 
287 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  34.66 
 
 
275 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.5 
 
 
285 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.73 
 
 
274 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.59 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.72 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.82 
 
 
277 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.08 
 
 
272 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 
274 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0799  ABC-3 protein  34.24 
 
 
265 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0822  ABC-3 protein  34.24 
 
 
265 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  30.86 
 
 
287 aa  148  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  35.71 
 
 
273 aa  148  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  32.68 
 
 
281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.08 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  36.22 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  35.02 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.06 
 
 
280 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  33.72 
 
 
264 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.77 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.77 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
273 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 
275 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
272 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  32.58 
 
 
275 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  32.03 
 
 
273 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.95 
 
 
300 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  33.96 
 
 
290 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  33.96 
 
 
290 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.27 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  30.68 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  32.05 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29 
 
 
285 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  32.1 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.15 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  30.3 
 
 
272 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  31.2 
 
 
268 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.25 
 
 
287 aa  137  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  27.99 
 
 
269 aa  137  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  30.74 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  30.74 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  30.74 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.43 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  28.57 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  31.06 
 
 
264 aa  136  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.16 
 
 
280 aa  136  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.1 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  31.18 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  30.4 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  28.09 
 
 
267 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  31.75 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  27.11 
 
 
277 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.09 
 
 
267 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  31.89 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  27.61 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  28.68 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  28.28 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  28.46 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  30.58 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  29.74 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  26.24 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  28 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  31.85 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  32.03 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  29.59 
 
 
285 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  32.18 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  29.26 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  32.3 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  28.14 
 
 
289 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  27.31 
 
 
276 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  29.21 
 
 
280 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  32.31 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  31.72 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.35 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  28.22 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  28.63 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  30.83 
 
 
271 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  31.5 
 
 
312 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  28.11 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  30.52 
 
 
271 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.3 
 
 
278 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  30.65 
 
 
294 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.3 
 
 
278 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  29.24 
 
 
263 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  34.5 
 
 
269 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  30.19 
 
 
280 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  29.55 
 
 
282 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  26.64 
 
 
273 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>