More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17100 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 		 308 aa  577  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  59.34 
 
 		 310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  56.55 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  57.14 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  55.15 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  49.29 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  49.01 
 
 		 289 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  61.8 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  49.01 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  44.59 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  44.63 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  47.15 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  49.61 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  43.1 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  47.9 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  47.48 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  36.73 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40.98 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.27 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.27 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.27 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  35.64 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.27 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.27 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  35.45 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  37.31 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.64 
 
 		 277 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 276 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  37.01 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  36.33 
 
 		 265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  34.63 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  35.13 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  33.45 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  33.97 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  37.27 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.3 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.77 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  29.35 
 
 		 266 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  38.37 
 
 		 268 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  32.85 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.29 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  36.7 
 
 		 352 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  34.66 
 
 		 371 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  35.6 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  30.26 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  30.26 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  35.36 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  34.83 
 
 		 270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.51 
 
 		 270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  26.71 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  31.5 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  39.33 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.12 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.48 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.67 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.31 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  32.72 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.88 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.58 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  28.32 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.22 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.22 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.88 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  31.72 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  29.78 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  31.41 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  27.65 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  30.16 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  26.84 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  26.98 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  30.94 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18250  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.62 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  28.89 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.05 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.56 
 
 		 276 aa  99.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.76 
 
 		 285 aa  99  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  28.83 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  29.35 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  22.06 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 262 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  27.08 
 
 		 277 aa  96.7  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 		 278 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>