More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0518 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  100 
 
 		 269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  52.85 
 
 		 266 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  45.08 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  45.78 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  44.49 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  39.77 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  38.66 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  42.17 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  40.91 
 
 		 264 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  36.8 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  36.33 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  42 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  35.42 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.96 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  31.95 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.43 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  31.99 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  31.11 
 
 		 361 aa  148  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  35.11 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  34.77 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.26 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  34.34 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  29.85 
 
 		 289 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.63 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  32.16 
 
 		 297 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  34.08 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  31.54 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.82 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  32.72 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  31.5 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.72 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.72 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.72 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 		 277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  30.37 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.09 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  32.94 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  32.94 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.13 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  34.82 
 
 		 339 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  30.52 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  30.62 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.27 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  29.41 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.14 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  32.05 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.97 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  25.88 
 
 		 337 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  29.41 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  31.07 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  26.82 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.68 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  30.92 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  31.05 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.08 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.73 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  28.99 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  27.24 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  31.2 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  26.39 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  26.39 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  26.79 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  29.12 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  30.16 
 
 		 357 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  29.18 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  29.18 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  29.18 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  24.62 
 
 		 405 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  30.08 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  29.57 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  28.35 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  28.98 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  28.35 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  28.35 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  28.35 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  27.99 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  31.25 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.77 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  31.1 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  28.35 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  28.35 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>