More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0493 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  80.51 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  72.76 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  68.63 
 
 		 274 aa  360  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  68.63 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  62.13 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  61.76 
 
 		 277 aa  289  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  39.41 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  40.15 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  42.01 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  36.5 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  37.41 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  36.26 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  36.13 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  34.7 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  39.77 
 
 		 283 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.77 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  38.58 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.77 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.77 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.77 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.77 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  39.23 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  36.59 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  36.09 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  36.94 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  39.22 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  35.74 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  35.74 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  37.31 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  39.93 
 
 		 267 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  36.61 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  35.74 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  40.48 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  39.54 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  38.04 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  38.55 
 
 		 281 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  35.07 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 280 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  36.8 
 
 		 361 aa  148  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  39.41 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  38.08 
 
 		 289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  37.4 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  36.55 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  39.92 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  34.36 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  34.65 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  33.95 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  37.16 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 285 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  37.45 
 
 		 275 aa  141  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  35.19 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  34.13 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  34.78 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  34.13 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  34.13 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  39.29 
 
 		 339 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  34.13 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  34.13 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  34.13 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  34.13 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  34.13 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  34.13 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  34.07 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  34.93 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  34.09 
 
 		 337 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  32.33 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  34.93 
 
 		 290 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  34.98 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  33.72 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  33.72 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  33.72 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  33.72 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  33.72 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.77 
 
 		 330 aa  135  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  37.5 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  34.94 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18250  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.98 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.59 
 
 		 310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  34.11 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  36.05 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  30.52 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  35.98 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  38.91 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>