More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18250 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_18250  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 
283 aa  541  1e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  56.44 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  42.28 
 
 
272 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  37.45 
 
 
272 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  37.31 
 
 
274 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  37.6 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  36.8 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  35.34 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  32.75 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.95 
 
 
277 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  37.88 
 
 
339 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.39 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  31.23 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.62 
 
 
308 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  31.43 
 
 
300 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.76 
 
 
272 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  30.86 
 
 
291 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  34.2 
 
 
312 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  34.4 
 
 
337 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  30.55 
 
 
289 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.14 
 
 
277 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  31.23 
 
 
283 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.95 
 
 
272 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  34.07 
 
 
312 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.13 
 
 
281 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.99 
 
 
280 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  29.74 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  33.47 
 
 
310 aa  98.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  28.79 
 
 
304 aa  97.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.41 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  30.08 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.08 
 
 
330 aa  96.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  33.86 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  30.34 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1595  ABC-3 protein  35.04 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.425587  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  29.62 
 
 
280 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  31.76 
 
 
371 aa  95.5  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  30.37 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  29.7 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.95 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  29.62 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  29.34 
 
 
272 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  29.18 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30.59 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  32.34 
 
 
268 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  30.89 
 
 
268 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  28.85 
 
 
276 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  32.61 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  31.7 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  28.46 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  28.79 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  28.79 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  28.79 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  28.79 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  31.37 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  28.79 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.34 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.34 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.41 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.03 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  28.41 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.77 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  26.89 
 
 
266 aa  89  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  29.74 
 
 
281 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  26.38 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  28.96 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.23 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.32 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  26.48 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  26.48 
 
 
288 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  24.71 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  29.66 
 
 
326 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  26.15 
 
 
278 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  28.1 
 
 
287 aa  87  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  27.78 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  30.82 
 
 
352 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.94 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 
277 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.94 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  29.28 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  28.79 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  29.54 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  31.6 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  28.9 
 
 
271 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  31.68 
 
 
269 aa  85.9  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 
282 aa  85.5  9e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  30.31 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  26.35 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  30.53 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  25.57 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  25.64 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  25.64 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  29.39 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  28.2 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.89 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>