More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2573 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  100 
 
 
276 aa  535  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  62.36 
 
 
281 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  63.4 
 
 
280 aa  329  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  60.51 
 
 
300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  61.48 
 
 
278 aa  321  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  61.48 
 
 
278 aa  321  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  59.26 
 
 
297 aa  288  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  46.01 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  47.81 
 
 
277 aa  241  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  47.23 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  47.23 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  42.96 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  43.49 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  46.13 
 
 
312 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  41.16 
 
 
288 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
288 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  39.11 
 
 
297 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  39.11 
 
 
297 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  41.3 
 
 
288 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  41.3 
 
 
288 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  43.54 
 
 
283 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  39.11 
 
 
297 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  39.86 
 
 
282 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  39.72 
 
 
288 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  39.56 
 
 
294 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  39.42 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  40.22 
 
 
285 aa  198  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  38.77 
 
 
290 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  37.59 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  39.93 
 
 
285 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  39.64 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  38.46 
 
 
279 aa  195  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  39.86 
 
 
292 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  39.18 
 
 
279 aa  194  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  39.49 
 
 
290 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  41.76 
 
 
279 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  39.48 
 
 
291 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  40 
 
 
285 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  39.11 
 
 
290 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  40.36 
 
 
285 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  39.11 
 
 
290 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  36.23 
 
 
278 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  36.23 
 
 
278 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  40.51 
 
 
289 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  38.01 
 
 
274 aa  188  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  36.96 
 
 
283 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  40.22 
 
 
285 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  43.54 
 
 
291 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  40.93 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  39.93 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  38.83 
 
 
290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  38.77 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  38.81 
 
 
289 aa  182  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  37.64 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  37.09 
 
 
282 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  37.09 
 
 
282 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  36.03 
 
 
294 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  37.09 
 
 
282 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  39.54 
 
 
287 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  37.09 
 
 
282 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  37.09 
 
 
282 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  38.6 
 
 
287 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  38.24 
 
 
287 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  36.3 
 
 
285 aa  178  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  37.86 
 
 
285 aa  178  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  38.95 
 
 
289 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  42.86 
 
 
281 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  38.03 
 
 
286 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  40.65 
 
 
278 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  35.84 
 
 
285 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  38.18 
 
 
285 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  36.3 
 
 
296 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  39.1 
 
 
291 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  43.06 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  34.29 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  35.11 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  34.29 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  34.29 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  34.29 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  37.55 
 
 
286 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  41.76 
 
 
280 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  34.29 
 
 
286 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  37.55 
 
 
286 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  35.66 
 
 
286 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  36.53 
 
 
299 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  36.9 
 
 
287 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  37.08 
 
 
291 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  42.05 
 
 
303 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  36.09 
 
 
285 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  40.23 
 
 
282 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  34.4 
 
 
285 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  40.38 
 
 
282 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.42 
 
 
285 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  42.07 
 
 
289 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  33.95 
 
 
286 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  38.15 
 
 
304 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  36.43 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  41.3 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>