More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0853 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  100 
 
 		 352 aa  681    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  69.05 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  60.27 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  56.99 
 
 		 371 aa  363  3e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  50.78 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  45.71 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  49.8 
 
 		 357 aa  222  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  48.67 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  49.53 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  38.02 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  38.55 
 
 		 289 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  32.59 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  37.4 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  35.52 
 
 		 277 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  35.61 
 
 		 272 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  39.18 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.16 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 277 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.73 
 
 		 272 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 277 aa  144  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  32.46 
 
 		 277 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  37.08 
 
 		 291 aa  143  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.09 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.09 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.09 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.09 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  36.5 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.72 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.7 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  32.09 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  36.22 
 
 		 339 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.09 
 
 		 310 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  35.96 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  30.66 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 272 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  32.38 
 
 		 265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  34.5 
 
 		 277 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  27.82 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  27.82 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.68 
 
 		 274 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  30.28 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.94 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  37.83 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  34.85 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 280 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  28.29 
 
 		 266 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  31.42 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  34.08 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  35.79 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 282 aa  119  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  36.07 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.37 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.66 
 
 		 276 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.68 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.45 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  28.9 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  35.5 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.34 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.57 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  32.08 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  30.99 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  34.25 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  23.14 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  27.03 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.13 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.08 
 
 		 266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  31.35 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  26.14 
 
 		 269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  26.25 
 
 		 264 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 		 262 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  29.41 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.1 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.01 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.01 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  28.73 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  30.27 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  30.11 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  31.7 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  26.87 
 
 		 268 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  31.87 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  28.74 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>