More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0291 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 278 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  83.09 
 
 		 278 aa  461  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  83.09 
 
 		 278 aa  461  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  49.47 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  53.17 
 
 		 288 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  49.47 
 
 		 288 aa  280  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  53.17 
 
 		 288 aa  280  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  49.12 
 
 		 288 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  53.78 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  46.15 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  47.81 
 
 		 277 aa  251  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  49.61 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  48.03 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  42.64 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  46.72 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  40.75 
 
 		 281 aa  211  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  37.09 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  37.09 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  37.09 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  39.77 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  43.14 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  41.2 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  42.05 
 
 		 278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  42.05 
 
 		 278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  40.8 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  38.4 
 
 		 285 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  41 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  38.61 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  43.38 
 
 		 289 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  38.4 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  43.67 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  40 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  41.92 
 
 		 290 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  37.31 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  38.01 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  41.5 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  36.84 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  37.31 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  42.69 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  39.16 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  39.16 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  37.91 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  35.93 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  40.4 
 
 		 290 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  37.55 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  44.49 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  32.33 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  34.7 
 
 		 285 aa  178  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  41 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  34.69 
 
 		 282 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  34.34 
 
 		 282 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  34.34 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  34.34 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  34.34 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.6 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  41.06 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  40.4 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.27 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  39.02 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.96 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  34.46 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  36.03 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.77 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  39.69 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  34.7 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  35.92 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  39.76 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  32.04 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  39.18 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  34.35 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  35.48 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  31.41 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  33.86 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  35.07 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  34.94 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  35.32 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  34.52 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  34.1 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  34.52 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  33.07 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  38.17 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  31.8 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  32.57 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  37 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.66 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.66 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.66 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  30.18 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.66 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  37.83 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.66 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.19 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  35.6 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  36.47 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  32 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>