More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3044 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  100 
 
 
289 aa  558  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  48.45 
 
 
287 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  42.09 
 
 
285 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  37.28 
 
 
288 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
288 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  37.28 
 
 
288 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  37.28 
 
 
288 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  38.87 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  39.7 
 
 
277 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  38.46 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  39.7 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  36.24 
 
 
288 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  44.36 
 
 
289 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  42.5 
 
 
304 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  41.03 
 
 
280 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  42.69 
 
 
287 aa  188  8e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.24 
 
 
279 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  40.51 
 
 
281 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  39.05 
 
 
312 aa  185  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  40.44 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.36 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  37.59 
 
 
294 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  40.51 
 
 
290 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  40.15 
 
 
290 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  36.05 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  36.05 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  43.56 
 
 
269 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  37.87 
 
 
291 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  41.26 
 
 
287 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  35.97 
 
 
300 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  35.84 
 
 
297 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  35.84 
 
 
297 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  35.84 
 
 
297 aa  176  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  37 
 
 
278 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  37 
 
 
278 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  39.19 
 
 
290 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  39.19 
 
 
290 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  36.7 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  37.45 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  36.4 
 
 
281 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  43.66 
 
 
278 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  41.26 
 
 
312 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  38.24 
 
 
276 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 
278 aa  167  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  37.5 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  39.19 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  39.43 
 
 
290 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  37.08 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  34.66 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  36.57 
 
 
275 aa  161  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  36.13 
 
 
290 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  37.69 
 
 
279 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  36.86 
 
 
290 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  40.66 
 
 
280 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  36.96 
 
 
289 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  35.91 
 
 
286 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  37.45 
 
 
274 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  39.05 
 
 
291 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  38.02 
 
 
289 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  38.43 
 
 
297 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  34.5 
 
 
280 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  35.55 
 
 
277 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  38.43 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  40.42 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  38.17 
 
 
267 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  39.77 
 
 
303 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  34.32 
 
 
281 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  34.27 
 
 
279 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  36.09 
 
 
285 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  33.58 
 
 
292 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  35.19 
 
 
286 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.33 
 
 
282 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  34.07 
 
 
283 aa  149  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  34.7 
 
 
283 aa  149  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  33.06 
 
 
285 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  33.06 
 
 
285 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.33 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.33 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  34.24 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  37.45 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  33.33 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  40.49 
 
 
264 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  35.14 
 
 
273 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  35.66 
 
 
291 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  33.57 
 
 
286 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  33.21 
 
 
285 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.98 
 
 
276 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  32.85 
 
 
285 aa  143  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  33.58 
 
 
285 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  33.96 
 
 
286 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  34.57 
 
 
294 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  32.49 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  32.49 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  35.97 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  32.85 
 
 
285 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  32.95 
 
 
272 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  32.1 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  32.95 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  32.48 
 
 
285 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  32.84 
 
 
286 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>