More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2066 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  100 
 
 
304 aa  588  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  44.65 
 
 
288 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  53.28 
 
 
280 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  44.81 
 
 
288 aa  239  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  54.01 
 
 
281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  45.69 
 
 
280 aa  233  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  45.19 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  45.19 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  45.62 
 
 
291 aa  223  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  42.91 
 
 
288 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.01 
 
 
279 aa  221  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  45.52 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  46.24 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  46.4 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  44.12 
 
 
281 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  42.45 
 
 
294 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  42.12 
 
 
285 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  48.19 
 
 
306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  45.26 
 
 
274 aa  215  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  42.97 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  48.18 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
277 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  45.79 
 
 
289 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  43.64 
 
 
290 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  42.03 
 
 
278 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  42.03 
 
 
278 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  40.66 
 
 
300 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  38.33 
 
 
301 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  42.31 
 
 
280 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  43.64 
 
 
290 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  44.48 
 
 
291 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  44.12 
 
 
289 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  38.38 
 
 
285 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  41.38 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  41.38 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  40.22 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  42.75 
 
 
303 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  47.01 
 
 
278 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  36.93 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  36.93 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  36.93 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  36.93 
 
 
286 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  40.57 
 
 
285 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  41.72 
 
 
297 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  36.59 
 
 
286 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  39.64 
 
 
285 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  42.5 
 
 
289 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  38.38 
 
 
297 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  40.58 
 
 
285 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  38.38 
 
 
297 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  38.38 
 
 
297 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  41 
 
 
278 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  39.26 
 
 
304 aa  188  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  39.07 
 
 
285 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  39.07 
 
 
285 aa  188  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  41.22 
 
 
275 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  41.03 
 
 
312 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  39.05 
 
 
290 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  39.19 
 
 
290 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  41.04 
 
 
279 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  36.76 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  37.5 
 
 
283 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  38.55 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  41.11 
 
 
285 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  39.78 
 
 
290 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  39.78 
 
 
290 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  38.63 
 
 
276 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  40.47 
 
 
441 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  38.13 
 
 
280 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  41 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.78 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  40.8 
 
 
441 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  37.28 
 
 
282 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  36.14 
 
 
282 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  36.36 
 
 
285 aa  179  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.78 
 
 
282 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.78 
 
 
282 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.78 
 
 
282 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  37.79 
 
 
278 aa  178  9e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  37.68 
 
 
281 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  37.72 
 
 
290 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  37.83 
 
 
294 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  37.18 
 
 
286 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  38.55 
 
 
282 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  36.8 
 
 
281 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  36.88 
 
 
285 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  39.93 
 
 
286 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  39.19 
 
 
291 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  38.55 
 
 
282 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  36.69 
 
 
285 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  41.18 
 
 
312 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0246  ABC-3 protein  39.77 
 
 
282 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  34.47 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  43.88 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  39.93 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  44.49 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  37.31 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  36.33 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  39.85 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>