More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1056 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  100 
 
 		 270 aa  523  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  64.18 
 
 		 269 aa  325  5e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  55.02 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  50.97 
 
 		 268 aa  249  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  46.69 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  41.54 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  42.17 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  39.08 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  40.74 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  41.76 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  38.29 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  39.26 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  39.26 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  39.26 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  39.26 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  39.26 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  39.26 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  39.26 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  39.34 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  39.71 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  43.09 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  37.2 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  36.54 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  36.54 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  42.69 
 
 		 285 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.08 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  35.6 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  35.41 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  35.41 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  34.09 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.47 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  32.14 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  36.44 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.47 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.06 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  33.21 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  35.46 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  32.46 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.12 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  32.94 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  28.78 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.69 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.76 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  34.14 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.27 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.83 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 361 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  36.6 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.74 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  28.46 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  28.46 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  33.97 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.57 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.69 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  34.68 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  30.94 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  34.62 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.85 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.98 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.41 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 272 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.24 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.02 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  31.5 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.74 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  34.14 
 
 		 301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  27.78 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  29.3 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  26.34 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  30.37 
 
 		 272 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  27.48 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  27.64 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  27.64 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  27.64 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  27.82 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  28.08 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  28.08 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  29.89 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  29.52 
 
 		 405 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  31.62 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>