More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2562 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 269 aa  514  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  50.58 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  50.58 
 
 		 269 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  42.64 
 
 		 284 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  40.47 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  42.21 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  41.76 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  41.11 
 
 		 264 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  42.91 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  37.6 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  35.63 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  36.78 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  36.78 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  43.03 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  37.55 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40.7 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  37.16 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  37.16 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  37.16 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  37.16 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  37.59 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  35.66 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  34.7 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  40.71 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  36.08 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  35.43 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.1 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  36.19 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  31.84 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.12 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  32.67 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  32.67 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  30.26 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  32.45 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 326 aa  139  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  33.82 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  31.72 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  32.27 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  33.6 
 
 		 336 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  35.89 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  29.48 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.41 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  31.89 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.97 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.97 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 361 aa  128  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  29.63 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  32.58 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  30.33 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.35 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  31.52 
 
 		 283 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.17 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.34 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  32.2 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.2 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  28.24 
 
 		 357 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 		 272 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  36.51 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.55 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.94 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  32.27 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.33 
 
 		 279 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  28.57 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.87 
 
 		 280 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.24 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11231  ABC transporter  32.42 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.09 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  31.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  26.49 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  30.71 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  26.49 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  29.25 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  26.49 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.08 
 
 		 308 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.09 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.74 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.47 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  28.69 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.52 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.97 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  32.08 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  32.08 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.56 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  28.25 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>