More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2565 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  92.31 
 
 		 286 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  73.65 
 
 		 286 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  75.44 
 
 		 285 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  75.46 
 
 		 286 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  73.65 
 
 		 286 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  73.65 
 
 		 286 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  73.65 
 
 		 286 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  72.76 
 
 		 285 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  71.43 
 
 		 285 aa  414  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  73.65 
 
 		 286 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  70.71 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  74.29 
 
 		 286 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  71.07 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  75.75 
 
 		 294 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  70.82 
 
 		 286 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  76.49 
 
 		 299 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  73.65 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  66.31 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  67.04 
 
 		 291 aa  348  5e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  62.5 
 
 		 286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  62.96 
 
 		 285 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  63.16 
 
 		 287 aa  333  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  62.28 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  62.28 
 
 		 294 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  62.78 
 
 		 287 aa  332  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  61.92 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  58.27 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  51.09 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  46.95 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  49.28 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  49.82 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  49.45 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  51.47 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  48.73 
 
 		 289 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  43.55 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  45.2 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  43.75 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  43.33 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  41.52 
 
 		 312 aa  208  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  43.33 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0724  AfeC  41 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.251948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  40.29 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  38.57 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  44.07 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  42.81 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  43.75 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  40.84 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  38.41 
 
 		 282 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  42.75 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  38.83 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  38.83 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  38.83 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.93 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  38.52 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.7 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  41.51 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.57 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.57 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.57 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  44.56 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  41.92 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  38.32 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  38.21 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  42.45 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  37.86 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  37.04 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  43.48 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  41.04 
 
 		 289 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  42.47 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  40.15 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  38.87 
 
 		 280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  43.14 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  38.41 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  38.32 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  38.32 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  36.13 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  35.4 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  35.4 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  39.71 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  34.89 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  36.12 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  35.79 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  43.02 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  37.14 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  38.64 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  37.32 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  36.33 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  38.52 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  37.88 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.72 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  37.23 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.07 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  38.61 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  38.41 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  38.22 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  37.26 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>