More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1027 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 263 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  96.58 
 
 		 263 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0695  ABC-3 protein  86.15 
 
 		 260 aa  407  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5933  ABC heavy metal transporter, inner membrane subunit  87.36 
 
 		 260 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2626  ABC-3 protein  87.31 
 
 		 260 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2650  ABC-3 protein  86.59 
 
 		 260 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2518  ABC-3 protein  84.73 
 
 		 262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1992  hypothetical protein  86.54 
 
 		 260 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2602  ABC-3 protein  86.54 
 
 		 260 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0715  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, inner membrane subunit  84.23 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.945899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3251  ABC-3 protein  83.14 
 
 		 260 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0485  ABC-3 protein  84.05 
 
 		 263 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.336382  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1956  ABC-3 protein  61.07 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.775188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  43.91 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3197  ABC-3 protein  42.91 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0514778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0295  ABC-3 protein  46 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  41.7 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  41.7 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  41.7 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2616  ABC-3 protein  41.38 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1186  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.92 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1456  ABC-3 protein  40.93 
 
 		 291 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5318  ABC-3 protein  40.32 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0805  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.62 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2477  hypothetical protein  43.36 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0749  Mn2+/Zn2+ ABC transporter permease  39.52 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.152299  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1720  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.11 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.798083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3198  ABC-3 protein  39.78 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0525861 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0605  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.11 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0757  ABC-3 protein  41.11 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.422432  normal  0.510372 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1609  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.71 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2088  ABC-3 protein  43.45 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4921  ABC-3 protein  38.27 
 
 		 298 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2476  hypothetical protein  42.13 
 
 		 303 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2615  ABC-3 protein  39.3 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0218  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000173393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2366  ABC-3 protein  46.28 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2374  ABC-3 protein  40.71 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000192422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0609  ABC-3 protein  37.92 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.746124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0984  ABC-3 protein  36.98 
 
 		 289 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.882822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0756  ABC-3 protein  35.08 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.929566  normal  0.294702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0604  cation ABC transporter, permease protein, putative  35.08 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2639  ABC-3 protein  40.27 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.668793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0294  ABC-3 protein  39.22 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  31.09 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.76 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.57 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2089  ABC-3 protein  37.59 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  27.57 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.47 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.63 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  27.51 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.46 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35280  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.6 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.74517  normal  0.501768 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.46 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.85 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  28.4 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.85 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  30.83 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  26.53 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.85 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.85 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.85 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  31.12 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.78 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  27.43 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0354  ABC-3 protein  35.81 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  28.24 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  30.31 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.85 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.6 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.85 
 
 		 288 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.24 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  29.05 
 
 		 276 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.46 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.38 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  26.19 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  27.85 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  27.82 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  33.79 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  25.66 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  25.66 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  27.85 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  27.72 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.21 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  28.75 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>