More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0044 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  100 
 
 
277 aa  534  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  66.92 
 
 
268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  56.23 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  53.46 
 
 
264 aa  280  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  55.02 
 
 
270 aa  275  7e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  52.06 
 
 
269 aa  253  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  49.26 
 
 
264 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  42.75 
 
 
269 aa  236  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  42.54 
 
 
266 aa  229  3e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  44.91 
 
 
276 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  40.6 
 
 
269 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  40.6 
 
 
269 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.41 
 
 
269 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  38.66 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
277 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
277 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  38.29 
 
 
277 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  35.82 
 
 
271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  37.92 
 
 
277 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  37.92 
 
 
277 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  37.92 
 
 
277 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 
277 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  37.92 
 
 
277 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  37.55 
 
 
277 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  38.83 
 
 
277 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  41.63 
 
 
280 aa  175  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  34.44 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  34.07 
 
 
289 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  38.67 
 
 
326 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.35 
 
 
272 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  35.9 
 
 
300 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 
270 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  33.33 
 
 
269 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  39.36 
 
 
285 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.84 
 
 
277 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  33.72 
 
 
291 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.66 
 
 
272 aa  152  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.4 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  35.69 
 
 
290 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  35.69 
 
 
290 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  34.98 
 
 
265 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.45 
 
 
330 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.85 
 
 
270 aa  149  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  31.4 
 
 
291 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  33.71 
 
 
268 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  36.72 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.77 
 
 
272 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  35.8 
 
 
361 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  32.72 
 
 
283 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.07 
 
 
274 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.54 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.07 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  36.86 
 
 
297 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.94 
 
 
281 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  33.09 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.71 
 
 
310 aa  138  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  32.97 
 
 
337 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  33.21 
 
 
277 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.33 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  33.6 
 
 
339 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.9 
 
 
308 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  32.49 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.7 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  33.1 
 
 
310 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.86 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  32.73 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  30.5 
 
 
337 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.06 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.54 
 
 
276 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  27.44 
 
 
272 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  27.44 
 
 
272 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  31.62 
 
 
267 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  34.8 
 
 
312 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  34.94 
 
 
301 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 
275 aa  122  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.93 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  32.27 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  33.6 
 
 
273 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  30.5 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.21 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  30.68 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  32.45 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  29.62 
 
 
278 aa  116  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  28.93 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  25.84 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.02 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.02 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  27.21 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.49 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  28.25 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  31.95 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  28.52 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  29.06 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.6 
 
 
288 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  29.41 
 
 
405 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.73 
 
 
287 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.6 
 
 
288 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>