More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1213 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  100 
 
 
268 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  46.4 
 
 
285 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  34.88 
 
 
276 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  36.74 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  36.29 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  34.55 
 
 
266 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  35.98 
 
 
264 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  39.22 
 
 
272 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  36.4 
 
 
291 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  37.01 
 
 
272 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  34.44 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  38.64 
 
 
267 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  40.87 
 
 
300 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.55 
 
 
330 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.19 
 
 
269 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  38.02 
 
 
289 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  37.45 
 
 
277 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  40.56 
 
 
339 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  35.4 
 
 
277 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  35.04 
 
 
272 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  40.44 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  34.07 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  33.7 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  33.7 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  33.7 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  33.7 
 
 
277 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  34.63 
 
 
269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 
269 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  35.47 
 
 
269 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  34.27 
 
 
290 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  33.72 
 
 
291 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  34.27 
 
 
290 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  35.32 
 
 
266 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  34.2 
 
 
277 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.82 
 
 
281 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  33.7 
 
 
265 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  35.94 
 
 
272 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  33.2 
 
 
284 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.46 
 
 
279 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  33.73 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.82 
 
 
280 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
282 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
270 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  38.37 
 
 
277 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  35.23 
 
 
283 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  34.92 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  30.62 
 
 
269 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  39.22 
 
 
301 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  35.23 
 
 
277 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  30.16 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  33.07 
 
 
336 aa  131  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.61 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.44 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  32.05 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  32.05 
 
 
272 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.27 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  29.2 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.33 
 
 
270 aa  129  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  38.37 
 
 
308 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  34.65 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.87 
 
 
285 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.92 
 
 
275 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  35.54 
 
 
280 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.88 
 
 
310 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  32.58 
 
 
270 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  33.83 
 
 
361 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  27.95 
 
 
268 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.82 
 
 
278 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.82 
 
 
278 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.6 
 
 
287 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  35.66 
 
 
310 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  33.83 
 
 
281 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  28.79 
 
 
268 aa  122  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  32.18 
 
 
371 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30 
 
 
274 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
273 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.89 
 
 
277 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  34.39 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
273 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  33.08 
 
 
276 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  34.73 
 
 
312 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  33.2 
 
 
273 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  31.76 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  34.98 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  34.81 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  27.1 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  34.57 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  29.5 
 
 
269 aa  116  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  36.69 
 
 
312 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  30.31 
 
 
261 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.96 
 
 
269 aa  116  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  32.95 
 
 
281 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  32.38 
 
 
261 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  31.2 
 
 
289 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>