More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1121 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 282 aa  527  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  87.86 
 
 		 290 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  87.86 
 
 		 290 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  55.27 
 
 		 277 aa  292  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  54.91 
 
 		 277 aa  285  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  54.91 
 
 		 277 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  54.91 
 
 		 277 aa  285  8e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  50.54 
 
 		 277 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  54.18 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  54.55 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  54.55 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  54.55 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  54.55 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  54.55 
 
 		 277 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  54.18 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  54.91 
 
 		 277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  42.29 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  39.56 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  44.19 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  40 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  34.04 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  36.73 
 
 		 269 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  35.8 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  33.95 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  35.91 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  35.14 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  36.33 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.96 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  35.36 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.91 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.85 
 
 		 269 aa  153  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.92 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  32.82 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  33.82 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  35.07 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  34.32 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.26 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  32.26 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  36.92 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.52 
 
 		 272 aa  149  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  33.84 
 
 		 297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  32.74 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.07 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  33.73 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.14 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  31.07 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  31.14 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.8 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.57 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  30 
 
 		 357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  27.74 
 
 		 279 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  32.98 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  28.32 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  32.96 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  29.45 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.09 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  30.11 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  28.83 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  28.26 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  29.96 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 371 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.29 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.05 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.74 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  31.66 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  31.48 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.74 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.74 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  27.34 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  28.57 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  30.59 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  30.31 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.32 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  27.57 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.16 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  30.59 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  27.96 
 
 		 405 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.25 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.25 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  28.74 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.31 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>