More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2006 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  100 
 
 
371 aa  713    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  60.47 
 
 
405 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  61.88 
 
 
337 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  58.17 
 
 
352 aa  346  3e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  48.35 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  44.25 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  47.86 
 
 
357 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  45.86 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  51.72 
 
 
320 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  37.36 
 
 
264 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  38.76 
 
 
277 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  33.46 
 
 
277 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  32.09 
 
 
276 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  37.55 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  35.79 
 
 
272 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.58 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.58 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.58 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.58 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.58 
 
 
277 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  32.58 
 
 
277 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  35.53 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.98 
 
 
272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.92 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 
277 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  35.36 
 
 
291 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  31.82 
 
 
277 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  35.82 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  31.32 
 
 
284 aa  136  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  37.11 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  33.84 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  30.77 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  29.84 
 
 
266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  35.56 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.18 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.68 
 
 
274 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  37.64 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  34.38 
 
 
339 aa  125  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.71 
 
 
308 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  30.36 
 
 
269 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  30.36 
 
 
269 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.64 
 
 
274 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.05 
 
 
281 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  29.78 
 
 
265 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
272 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  33.46 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32.84 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  31.23 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.09 
 
 
277 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.37 
 
 
280 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  28.46 
 
 
290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  28.46 
 
 
290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  26.82 
 
 
269 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.17 
 
 
304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.56 
 
 
310 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  29.48 
 
 
269 aa  116  6.9999999999999995e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  28.46 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  30.59 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.15 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.68 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  28.51 
 
 
282 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  34.59 
 
 
301 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.41 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  29.03 
 
 
270 aa  110  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28.41 
 
 
277 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.96 
 
 
285 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  31.6 
 
 
276 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  31.87 
 
 
267 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  27.2 
 
 
264 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  30.31 
 
 
271 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  32.12 
 
 
289 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  30.08 
 
 
268 aa  105  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  29.57 
 
 
266 aa  105  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.48 
 
 
288 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  30.77 
 
 
310 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  29.24 
 
 
293 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  31.65 
 
 
292 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.04 
 
 
280 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 
288 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  29.78 
 
 
279 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.41 
 
 
275 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  30.33 
 
 
312 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  28.68 
 
 
301 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.43 
 
 
287 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.8 
 
 
288 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.8 
 
 
288 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.14 
 
 
278 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.14 
 
 
278 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  24.81 
 
 
272 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  30.74 
 
 
269 aa  100  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  29.34 
 
 
261 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  29.34 
 
 
261 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  29.34 
 
 
261 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  29.34 
 
 
261 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  29.34 
 
 
261 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  29.34 
 
 
261 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  30.47 
 
 
280 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>