More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3413 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  100 
 
 		 278 aa  532  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  56.06 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  53.43 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  35.19 
 
 		 288 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  35.77 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  36.92 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  35.38 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  36.92 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  31.58 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  34.62 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  37.65 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  36.86 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  31.5 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.3 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  31.82 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  30.95 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.3 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.45 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  31.05 
 
 		 269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.73 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  32.81 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  30.58 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  29.43 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  29.62 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  30.27 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  28.06 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.74 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  31.82 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  27.09 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  31.47 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  32.26 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  28.75 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  31.56 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  31.97 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  32.16 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  29.39 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  30.08 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  27 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  29.39 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  30.2 
 
 		 289 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  32.02 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.89 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  29.02 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  29.18 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  29.01 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  27.97 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  30.27 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  29.39 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  29.77 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  32.16 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  30.04 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  32.41 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  29.01 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  29.01 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  31.35 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  29.39 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  30.83 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  28.96 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  28.96 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  28.96 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  26.82 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  28.19 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.29 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.57 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  29.32 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.2 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  30.53 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  29.07 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  29.43 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  32.71 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0315  hypothetical protein  32.08 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  28.75 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  30.89 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.02 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  30.27 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  27.41 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  28.78 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>