More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1010 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  100 
 
 		 288 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  35 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  34.98 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  36.15 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  35.17 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  34.75 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.35 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.35 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  34.4 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  34.03 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  34.03 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  34.07 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  29.79 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  34.32 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  33.58 
 
 		 291 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.34 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.07 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  32.71 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  34.39 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  35.84 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  35.04 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  28.97 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  35.32 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  30.74 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  32.4 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  31.87 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.22 
 
 		 272 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 		 261 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  34.57 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  33.6 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  33.62 
 
 		 289 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  33.6 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  33.83 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  34.01 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  33.08 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  34.01 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  35.41 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  34.01 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  34.01 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  34.01 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  28.02 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  33.2 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  31.88 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.34 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.74 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  33.33 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4953  hypothetical protein  33.98 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.37 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.37 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  33.33 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.85 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  29.28 
 
 		 280 aa  106  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  34.78 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  33.9 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  29.43 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  35.94 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  29.43 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  30.35 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  28.15 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  33.07 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  28.46 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  33.9 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1595  ABC-3 protein  40.43 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.425587  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  33.9 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  33.9 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.78 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.66 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  34.48 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  32.79 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  33.2 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.69 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.69 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.01 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  32.57 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  33.2 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  27.84 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11121  hypothetical protein  31.75 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.24 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  32.23 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>