More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000834 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  100 
 
 		 291 aa  564  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  95.88 
 
 		 291 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  85.17 
 
 		 291 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  54.48 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  53.28 
 
 		 299 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  52.98 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  52.63 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  52.92 
 
 		 299 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  52.92 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  53.11 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  54.58 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  47.08 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  54.38 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  54.38 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2388  ABC-3 transporter component  52.07 
 
 		 296 aa  258  6e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  32.82 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 288 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.41 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  29.46 
 
 		 283 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.57 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  29.12 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  34.09 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  28.47 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  26.54 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  26.54 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.58 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.35 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.35 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.35 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  29.67 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  29.48 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  26.6 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  27.91 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  34.48 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  28.14 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  26.77 
 
 		 280 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  26.36 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  26.36 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  27.94 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11121  hypothetical protein  32.34 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  26.38 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  26.38 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  28.26 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  27.21 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  28.62 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  31.77 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  32.83 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  31.33 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.47 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  30.94 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  29.6 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  27.13 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.23 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  27.74 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  28.89 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.35 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  29.37 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.94 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  29.6 
 
 		 357 aa  99.8  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  26.84 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  32.12 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  25.93 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  28.93 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.3 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  26.37 
 
 		 278 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  28.36 
 
 		 267 aa  99.4  7e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.96 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.96 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  29.96 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  28.52 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  29.59 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 273 aa  99  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.89 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  27.53 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.67 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  28.08 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4178  ABC-3 protein  28.91 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  29.96 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  30.53 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>