More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2388 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2388  ABC-3 transporter component  100 
 
 		 296 aa  551  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  71.18 
 
 		 299 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  72.47 
 
 		 301 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  72.13 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  69.44 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  69.44 
 
 		 299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  64.89 
 
 		 295 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  72.6 
 
 		 299 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  72.6 
 
 		 299 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  73.09 
 
 		 299 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  73.09 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  51.03 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  50.87 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  51.38 
 
 		 291 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  52.07 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  32.45 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  30.92 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  34.63 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.56 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  37.16 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  36.48 
 
 		 289 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  35.64 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.71 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.53 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.09 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  34.35 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  35.87 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 280 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  31.85 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.08 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  29.07 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.75 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  31.92 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  35.56 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  32.66 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  29.3 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  35.27 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.85 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  28.04 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  32.14 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  33.98 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.08 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.08 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  30.88 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.66 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  26.33 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  32.68 
 
 		 261 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  32.68 
 
 		 261 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  32.68 
 
 		 261 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  33.07 
 
 		 261 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  32.68 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  32.68 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  32.68 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  32.68 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  34.3 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  33.07 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  33.07 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  33.07 
 
 		 261 aa  99  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.21 
 
 		 266 aa  99  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.89 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  35.51 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  33.07 
 
 		 261 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  30.57 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  34.1 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  30.35 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.39 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.95 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  31.72 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  32.68 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  32.39 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  31.42 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  29.85 
 
 		 272 aa  97.4  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  29.96 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  35.15 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  31.42 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  32.3 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.15 
 
 		 288 aa  96.7  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 		 262 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  28.06 
 
 		 266 aa  95.9  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  30.07 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  30 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  31.2 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  35.16 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.34 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  32.57 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>