More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0125 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  100 
 
 		 291 aa  571  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  86.55 
 
 		 291 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  85.17 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  49.65 
 
 		 295 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  51.58 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  51.58 
 
 		 299 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  51.93 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 		 299 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  51.58 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  52.75 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  53.24 
 
 		 299 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  53.24 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  53.85 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  46.05 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2388  ABC-3 transporter component  50.87 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  32.57 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.72 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  30.27 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  29.84 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  31.02 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.13 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.05 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  34.85 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  37.97 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.15 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  30.66 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  28.9 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  28.9 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.95 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.41 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.97 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.99 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.99 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.99 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11121  hypothetical protein  31.62 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.71 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.48 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  28.85 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  27.9 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  31.77 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  30.83 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.37 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.91 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.91 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  28.21 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.07 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.78 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.8 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  34.36 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  30.92 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  30.92 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  30.92 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  30.92 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  30.92 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  29.23 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  30.92 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  27.91 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  25.83 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  27.97 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  28.63 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  29.96 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  30.53 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  30.53 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  26.59 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  27.3 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  29.78 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  28.04 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  27.86 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  29.17 
 
 		 262 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  28.62 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  27.6 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  27.44 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  30.07 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.82 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1695  ABC-3 protein  30.12 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1124  zinc ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.750494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  29.23 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>