More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0518 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 264 aa  497  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  67.06 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  63.78 
 
 		 268 aa  325  6e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  65.76 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  55.76 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  54.34 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  52.51 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  55.09 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  52.85 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  55.86 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  49.23 
 
 		 272 aa  248  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  49.62 
 
 		 272 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  50.76 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  48.06 
 
 		 279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  47.33 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  45.91 
 
 		 276 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  47.35 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  47.97 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  45.08 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  47.17 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  47.22 
 
 		 276 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  44.96 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  46.01 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  46.74 
 
 		 281 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  44.96 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  44.96 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  43.97 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  42.42 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  42.64 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  44.18 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  39.45 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  42.15 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  42.86 
 
 		 273 aa  166  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  33.88 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  36.54 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  35.11 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  38.82 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  37.75 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  40.08 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 		 293 aa  148  8e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  34.73 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.14 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.06 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  32.18 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.28 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.07 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.76 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.52 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.52 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.42 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  32.81 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  32.94 
 
 		 274 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.71 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  32.65 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  31.95 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.92 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.82 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  29.84 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.64 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 280 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.23 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  30.57 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  33.99 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.31 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  31.66 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.55 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  33.85 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  28.17 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.59 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  28.85 
 
 		 277 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  29.57 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  30.3 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3807  ABC-3 protein  37.15 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.7 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  32 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.7 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  32 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.7 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  29.46 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.62 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  28.9 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  29.5 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.31 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>