More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1590 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  100 
 
 
268 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1595  ABC-3 protein  59.27 
 
 
263 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.425587  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  38.29 
 
 
280 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  37.04 
 
 
277 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  37.31 
 
 
272 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  40.07 
 
 
279 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  35.45 
 
 
274 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  33.71 
 
 
268 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.44 
 
 
274 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  32.31 
 
 
272 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
275 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  37.9 
 
 
289 aa  146  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  36.08 
 
 
268 aa  145  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  37.31 
 
 
277 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  37.17 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  38.76 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  40.15 
 
 
299 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  35.74 
 
 
285 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  35.23 
 
 
285 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  39 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  39.77 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  35.29 
 
 
277 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  39.25 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
274 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  36.15 
 
 
294 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  39.39 
 
 
299 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 
272 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  40.23 
 
 
287 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  34.25 
 
 
261 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  35.09 
 
 
277 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.71 
 
 
266 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  33.98 
 
 
275 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  33.85 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  33.85 
 
 
272 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  34.09 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  34.55 
 
 
261 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  34.55 
 
 
261 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  35.04 
 
 
268 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  36.5 
 
 
295 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.234025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  34.55 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  34.55 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  34.55 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  34.55 
 
 
261 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  33.6 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  39.62 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  34.15 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  35.57 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  34.15 
 
 
261 aa  131  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  35.55 
 
 
275 aa  131  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  35.55 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  35.57 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  35.57 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  35.57 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  36.03 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  39.39 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  39.39 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  29.02 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  35.41 
 
 
271 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.3 
 
 
279 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  34.81 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  34.85 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  36.72 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  33.84 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  33.8 
 
 
300 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  33.98 
 
 
289 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  37.55 
 
 
269 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  34 
 
 
267 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  36.29 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
267 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
267 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  35.16 
 
 
276 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  35 
 
 
304 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  35.52 
 
 
272 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 
269 aa  123  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  37.93 
 
 
299 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  34.65 
 
 
261 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.03 
 
 
277 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  32.95 
 
 
261 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  37.93 
 
 
299 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  31.54 
 
 
269 aa  122  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  32.08 
 
 
265 aa  122  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  37.12 
 
 
269 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  32.17 
 
 
261 aa  121  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  29.84 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.46 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  36.72 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  38.28 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  34.66 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  29.32 
 
 
267 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  32.83 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  35.77 
 
 
262 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  33.33 
 
 
291 aa  118  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.64 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  34.78 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.7 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  34.54 
 
 
268 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>