More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0858 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  100 
 
 		 267 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0822  ABC-3 protein  43.08 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0799  ABC-3 protein  43.08 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0435  ABC-3 protein  45.69 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.149069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  34.35 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  31.23 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  31.23 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.23 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  30.62 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.25 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  32.43 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.04 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01359  hypothetical protein  30.5 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  28.14 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  29.1 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.28 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  26.69 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  31.49 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.08 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.89 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.31 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  28.35 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  28.35 
 
 		 288 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  28.35 
 
 		 288 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.1 
 
 		 285 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  30.37 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004108  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  30.89 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  28.17 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  30.23 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  30.23 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  29.96 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  29.64 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  28.24 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0517  putative cation ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  28.92 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0850  high-affinity zinc uptake system membrane protein ZnuB  28.81 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.714968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  33.49 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  25.84 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  28.94 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  28.94 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.81 
 
 		 279 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  27.95 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  28.4 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.13 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  28.91 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  25.86 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  29.09 
 
 		 262 aa  111  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  27.98 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  31.89 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29.21 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  26.92 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  27.35 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  27.35 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  26.77 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0514  ABC transporter  28.84 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0274636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  25.77 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  28.24 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  29.85 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  29.85 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  30.95 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  27.05 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  28.52 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  27.71 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.75 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.75 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  26.92 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  28.78 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.75 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  26.79 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  30.26 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  25.78 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  26.17 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  27.56 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  26.32 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  28.36 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  27.35 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  26.56 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  26.56 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  26.56 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  24.41 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>