More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0799 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0822  ABC-3 protein  100 
 
 
265 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0799  ABC-3 protein  100 
 
 
265 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0435  ABC-3 protein  53.73 
 
 
262 aa  229  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.149069  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0858  ABC-3 protein  43.08 
 
 
267 aa  205  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0139094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  34.24 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  33.72 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
272 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  36.14 
 
 
264 aa  125  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.4 
 
 
268 aa  125  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.72 
 
 
272 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.52 
 
 
280 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.68 
 
 
279 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  34.73 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.66 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.67 
 
 
268 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.4 
 
 
274 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.74 
 
 
277 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  30.35 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  27.95 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.33 
 
 
285 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 
267 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  29.46 
 
 
267 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  30.2 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  29.84 
 
 
280 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30.95 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  31.7 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  30.3 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  28.57 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  30.36 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  29.55 
 
 
279 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  31.15 
 
 
277 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 
275 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.68 
 
 
267 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  31.45 
 
 
267 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  33.21 
 
 
276 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  29.84 
 
 
277 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  34.66 
 
 
267 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  29.72 
 
 
271 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  32.7 
 
 
273 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 
274 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  31.37 
 
 
272 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29.62 
 
 
277 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  34.36 
 
 
281 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  30.16 
 
 
268 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  30.74 
 
 
275 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  30.2 
 
 
289 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  31.01 
 
 
269 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.17 
 
 
282 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.17 
 
 
282 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  30.4 
 
 
268 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.17 
 
 
282 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  31.17 
 
 
282 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
273 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.17 
 
 
288 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  28.52 
 
 
278 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  28.52 
 
 
278 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.17 
 
 
288 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.17 
 
 
288 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  28.4 
 
 
273 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.17 
 
 
288 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 
269 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  29.8 
 
 
269 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
278 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.77 
 
 
282 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 
277 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 
277 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.74 
 
 
297 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.96 
 
 
277 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.74 
 
 
297 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.74 
 
 
297 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  26.95 
 
 
280 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  31.17 
 
 
268 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  31.27 
 
 
273 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3777  ABC-3 protein  31.66 
 
 
270 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  29.46 
 
 
285 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  29.41 
 
 
277 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  30.4 
 
 
268 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  30.89 
 
 
300 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  29.73 
 
 
277 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.84 
 
 
285 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.34 
 
 
277 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  29.8 
 
 
290 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  32.2 
 
 
275 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  29.07 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  27.71 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  29.96 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  29.34 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  27.13 
 
 
288 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  29.73 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  29.73 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  29.73 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  29.73 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  29.02 
 
 
304 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  29.8 
 
 
273 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  27.91 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  30.23 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>