More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3053 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  99.65 
 
 
282 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  99.65 
 
 
282 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  99.65 
 
 
282 aa  550  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  100 
 
 
282 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  99.29 
 
 
282 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  70.74 
 
 
279 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  69.52 
 
 
285 aa  381  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  68.15 
 
 
285 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  68.38 
 
 
292 aa  377  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  71.38 
 
 
281 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  65.34 
 
 
282 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  64.1 
 
 
285 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  68.06 
 
 
279 aa  345  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  59.27 
 
 
283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  61.9 
 
 
285 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  61.92 
 
 
282 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0246  ABC-3 protein  62.07 
 
 
282 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  61.54 
 
 
282 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  51.81 
 
 
297 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  51.81 
 
 
297 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  51.81 
 
 
297 aa  289  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  54.2 
 
 
285 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  54.31 
 
 
276 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  50.51 
 
 
301 aa  280  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  52.4 
 
 
286 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  50.55 
 
 
285 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  50.55 
 
 
275 aa  265  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  49.46 
 
 
285 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  48.87 
 
 
280 aa  253  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  49.24 
 
 
294 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  45.88 
 
 
291 aa  236  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  49.24 
 
 
274 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  47.71 
 
 
291 aa  222  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  45.75 
 
 
290 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  45.75 
 
 
290 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  47.92 
 
 
289 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  40.38 
 
 
286 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  42.21 
 
 
291 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  39.08 
 
 
285 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  42.4 
 
 
312 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  47.33 
 
 
289 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  39.19 
 
 
280 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  46.18 
 
 
290 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  46.18 
 
 
290 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  38.43 
 
 
285 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  45.19 
 
 
314 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  39.33 
 
 
281 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  42.59 
 
 
286 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  40.98 
 
 
294 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  40.75 
 
 
286 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  44.98 
 
 
290 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  45.05 
 
 
276 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  38.87 
 
 
285 aa  202  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  40.38 
 
 
286 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  38.87 
 
 
285 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  40.38 
 
 
286 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  40.38 
 
 
286 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  40.38 
 
 
286 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  38.87 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  45.78 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  42.37 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  41.22 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  41.67 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  40.08 
 
 
286 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  42.11 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  43.87 
 
 
306 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  41.83 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  42.32 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  41.22 
 
 
286 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  44.79 
 
 
304 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  42.26 
 
 
294 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  45.71 
 
 
303 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  42.26 
 
 
294 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  42.26 
 
 
294 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  38.83 
 
 
288 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  38.83 
 
 
288 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  41.27 
 
 
299 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  39.02 
 
 
286 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  40.86 
 
 
280 aa  189  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  40.82 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  40.82 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.59 
 
 
285 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  36.64 
 
 
277 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  47.13 
 
 
289 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  39.69 
 
 
286 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  39.69 
 
 
286 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  40.15 
 
 
278 aa  187  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  35.34 
 
 
278 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  35.34 
 
 
278 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  42.52 
 
 
296 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  40.07 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  40.07 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  38.11 
 
 
271 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  39.19 
 
 
288 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  38.78 
 
 
304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  42.16 
 
 
295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  40.15 
 
 
289 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  47.04 
 
 
291 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  41.2 
 
 
297 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  37.09 
 
 
276 aa  171  9e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>