More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0037 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 269 aa  518  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  68.66 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  68.28 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  67.91 
 
 		 267 aa  360  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  58.82 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  59.04 
 
 		 268 aa  294  9e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  55.86 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  52.61 
 
 		 275 aa  273  3e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  50.56 
 
 		 269 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  50.96 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  48.05 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  49.81 
 
 		 279 aa  248  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  51.64 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  48.46 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  48.67 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  45.9 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  45.87 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  45.45 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  41.41 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 		 275 aa  208  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  41.38 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  44.92 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  42.01 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  43.75 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  42.32 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  44.44 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  40.52 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  40.15 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  43.31 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  41.34 
 
 		 281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  42.02 
 
 		 269 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  40.23 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  38.96 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.46 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  31.84 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  31.84 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  40.16 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  34.22 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.2 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.18 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.99 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  32.43 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  30.2 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  29.6 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 		 278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  35.34 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  33.72 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  30.37 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  29.21 
 
 		 276 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  28.74 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.82 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  29.8 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.47 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.92 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.9 
 
 		 280 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.52 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.52 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  32.31 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.82 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  30.18 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.41 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.74 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.08 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.74 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.74 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.65 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  32.02 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  30.36 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  30.95 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  29.43 
 
 		 303 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  28.73 
 
 		 281 aa  118  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.06 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  29.88 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.06 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  29.32 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.55 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  27.38 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  28.85 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  28.92 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  27.69 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  27.94 
 
 		 290 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  27.92 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  28.34 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  31 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  29.28 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  25.65 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.66 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1098  hypothetical protein  31.17 
 
 		 282 aa  112  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  28.46 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>