More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0197 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  100 
 
 
269 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  73.46 
 
 
269 aa  332  6e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  71.26 
 
 
273 aa  324  8.000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  66.16 
 
 
275 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  70.04 
 
 
273 aa  305  6e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  66.67 
 
 
272 aa  299  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  60.47 
 
 
275 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  57.81 
 
 
274 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  57.36 
 
 
273 aa  271  6e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  59.85 
 
 
273 aa  271  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  69.35 
 
 
273 aa  269  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  52.47 
 
 
266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  57.74 
 
 
281 aa  262  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  52.34 
 
 
277 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  49.21 
 
 
272 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  48.82 
 
 
272 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  47.27 
 
 
275 aa  232  6e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  47.24 
 
 
268 aa  228  8e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  48.85 
 
 
276 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  49.61 
 
 
273 aa  225  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  46.85 
 
 
268 aa  224  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  46.95 
 
 
276 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  54.3 
 
 
269 aa  222  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  48.36 
 
 
273 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 
264 aa  216  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  51.19 
 
 
281 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  47.54 
 
 
274 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  42.42 
 
 
279 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  41.47 
 
 
267 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  43.41 
 
 
269 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  41.47 
 
 
267 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  40.7 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  47.15 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  49.4 
 
 
277 aa  198  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 
269 aa  196  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  43.24 
 
 
275 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  43.19 
 
 
279 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  42.17 
 
 
268 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  39.76 
 
 
277 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  36.02 
 
 
267 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  40 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  42.63 
 
 
267 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  37.98 
 
 
285 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  34.5 
 
 
272 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  35.74 
 
 
287 aa  149  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.47 
 
 
280 aa  148  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.77 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.94 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.24 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 
293 aa  143  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  33.83 
 
 
272 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  37.65 
 
 
280 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.1 
 
 
288 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.97 
 
 
277 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 
288 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.33 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.33 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  36.03 
 
 
300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  35.71 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.02 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  32.95 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.95 
 
 
289 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.2 
 
 
272 aa  136  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.5 
 
 
280 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.43 
 
 
304 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  38.1 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  33.33 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  35.6 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.95 
 
 
268 aa  133  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.1 
 
 
281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  37.45 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  31.4 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  33.46 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.89 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  31.08 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
272 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  35.74 
 
 
312 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  29 
 
 
285 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  34.1 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  37.84 
 
 
281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3807  ABC-3 protein  39.84 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  31.64 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1683  ABC-3 protein  34.24 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  37.55 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  33.71 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  27.94 
 
 
285 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  29.64 
 
 
279 aa  126  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  31.13 
 
 
301 aa  125  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  29.1 
 
 
277 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.68 
 
 
291 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.75 
 
 
330 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1595  ABC-3 protein  37.35 
 
 
263 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.425587  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  31.5 
 
 
278 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  31.5 
 
 
278 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.85 
 
 
297 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.85 
 
 
297 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>