More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0335 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  100 
 
 		 283 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  56.06 
 
 		 278 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3489  ABC-3 protein  48.2 
 
 		 280 aa  234  9e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  36.15 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3929  hypothetical protein  31.82 
 
 		 299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.632836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  32.58 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  32.2 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1966  ABC-3 protein  31.44 
 
 		 299 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3803  hypothetical protein  31.44 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.208083  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  31.39 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2088  ABC-3 protein  31.78 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.446379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0307  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2113  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  30 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  28.17 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33540  putative permease of ABC transporter  30.98 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00783017  normal  0.0257803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  30.37 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2850  ABC transporter permease  30.98 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  30 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3593  ABC-3 protein  31.3 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.234025 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  32.89 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  30.22 
 
 		 277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  33.96 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  34.33 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  29 
 
 		 277 aa  119  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  34.33 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  29.85 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.39 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  30.48 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  30.48 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  30.48 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  30.48 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  33.2 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1197  ABC-3 protein  32.94 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620873  normal  0.0904555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.11 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  28.35 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  28.92 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  33.73 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  33.07 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  33.46 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0362  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.41 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.42 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.33 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.85 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  32.79 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  31.01 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  31.99 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  31.99 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  32.63 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  31.99 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  29.62 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  26.69 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.42 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0125  ABC-3 transporter protein, membrane component  28.9 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.291057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  30.08 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  33.05 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  28.69 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  28.9 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  33.05 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  29.26 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  28.63 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2388  ABC-3 transporter component  30.92 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  27.42 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  31.92 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  31.92 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06743  hypothetical protein  29.28 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  34.73 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  28.84 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  27.06 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  30.3 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  28.29 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.05 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4137  ABC-3 protein  31.78 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  36.86 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000834  putative permease of ABC transporter  28.29 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.121337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>