More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2036 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  100 
 
 		 312 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  88.46 
 
 		 312 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  66.9 
 
 		 287 aa  380  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  60.93 
 
 		 287 aa  325  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  62.36 
 
 		 280 aa  289  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 288 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  42.81 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  42.81 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  42.81 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  41.03 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  39.78 
 
 		 289 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  39.93 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  42.39 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  37.63 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  41.26 
 
 		 289 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  42.32 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  40.07 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  42.32 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  39.01 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  39.93 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  40.53 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  39.48 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  43.75 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.21 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  37.72 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  38.95 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  38.95 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  39.05 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  37.46 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  35.98 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  36.79 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  37.14 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  37.41 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  37.5 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  37.41 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  37.41 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  36.26 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  40.23 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  44.96 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  40.15 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  38.57 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  37.59 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  36.07 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  33.82 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  37.41 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  34.11 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  33.82 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  36.43 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  40.24 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  33.82 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  33.82 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  33.82 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  33.82 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  38.91 
 
 		 441 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  34.75 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  32 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  38.64 
 
 		 441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  34.66 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 280 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  34.58 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  34.38 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  32.73 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.93 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 286 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 274 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  37.31 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  35.64 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  37.68 
 
 		 276 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  35.37 
 
 		 415 aa  149  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  35.25 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  33.83 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.2 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  32.2 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  33.46 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  34.35 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  38.32 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  37.67 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  32.71 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  34.53 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  34.94 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  32.71 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  34.74 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  34.35 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  32.87 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  33.47 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  32.87 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  35.69 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.82 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>