More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0532 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  43.13 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  43.3 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  43.95 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  43.95 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  42.86 
 
 		 287 aa  201  9e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  41.57 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  40.98 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  43.56 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  44.49 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  46.04 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  48.62 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  39.55 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  48.22 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  40.52 
 
 		 282 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  40.15 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  40.46 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  39.63 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  40 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  40 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  38.06 
 
 		 297 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  38.06 
 
 		 297 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  42.16 
 
 		 291 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  38.06 
 
 		 297 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  40.22 
 
 		 285 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  40.37 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  40.37 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  39.62 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  35.61 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  38.35 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  38.35 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  39.03 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  38.01 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  41.44 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  39.85 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.87 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  39.64 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  39.27 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  39.54 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  39.54 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.93 
 
 		 279 aa  175  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  39.27 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  39.27 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  39.27 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  38.78 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  42.03 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  45.82 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  40.84 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  41 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  40.38 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  38.35 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  40.08 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  43.65 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  40.68 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  39.08 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  39.85 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  39.78 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  39.53 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  35.83 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  35.83 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  37.68 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  37.4 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  40.37 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  39.62 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  43.33 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  40.38 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  40.47 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  40.6 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  34.19 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  38.49 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07780  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.11 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6286  ABC-3 protein  41.54 
 
 		 292 aa  158  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  40.3 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  39.1 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  41.26 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.76 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  41.22 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  37.01 
 
 		 291 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  42.13 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  35.83 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  43.41 
 
 		 303 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  36.33 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  36.33 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  39.25 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5325  ABC-3 protein  40.37 
 
 		 664 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  39.71 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 286 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  34.46 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  32.96 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  38.91 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  38.95 
 
 		 276 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  38.4 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  36.19 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  44.07 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  38.91 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  44.36 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  32.33 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>